Marokko ist eines der Zielländer im Programm „CLIENT II – Internationale Partnerschaften für nachhaltige Innovationen“ des Rahmenprogramms „Forschung für nachhaltige Entwicklung“ des Bundesministeriums für Bildung und Forschung (BMBF). Ziel des Programms ist die Förderung nachfrageorientierter Forschungs-und-Entwicklungs-Kooperationen mit Partnern in ausgewählten Schwellen- und Entwicklungsländern. Thematische Schwerpunktbereiche der Marokko-Kooperation in CLIENT II sind:

• Klimaschutz/Energieeffizienz,
• Anpassung an den Klimawandel,
• nachhaltiges Landmanagement und
• nachhaltige Energiesysteme.

PRIMA - Partnerschaft für Forschung und Innovation im Mittelmeerraum

Neben der bilateralen Zusammenarbeit kooperieren Deutschland und Marokko auch im Rahmen von EU-Projekten und transnationalen Förderprogrammen. Beide Länder arbeiten zum Beispiel intensiv bei der Implementierung von Projekten in der PRIMA (Partnership for Research and Innovation in the Mediterranean Area)-Initiative zusammen. Thematische Schwerpunkte sind dabei Nahrungsmittel, Wasser und Landwirtschaftssysteme. 

Transregionale und interdisziplinäre Zusammenarbeit in der Arab-German Young Academy of Sciences and Humanities (AGYA)

Die Aktivitäten und Forschungsvorhaben des vom BMBF geförderten Exzellenznetzwerkes AGYA an der Berlin-Brandenburgischen Akademie der Wissenschaften sind grundsätzlich arabisch-deutsch mit transregionalem Ansatz, der dezidiert arabisch-deutsche und arabisch-arabisch-deutsche Kooperationen fördert. In sechs Arbeitsgruppen (Energie, Wasser und Umwelt; Bildung; Transformation; Kulturelles Erbe; Gesundheit und Gesellschaft; Forschung und Innovation) werden vor allem interdisziplinäre Forschungsprojekte durchgeführt. Zu den Mitgliedern und Alumni von AGYA gehören auch marokkanische Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler.